Ein Vorgängerbau der heutigen St.-Cyriakus-Kirche in Wolferode wurde wohl 1336 von Mönchen aus dem Benediktinerkloster Wimmelburg errichtet. Sie wurde dem Patron der Klosterkirche, dem hl. Cyriakus geweiht. Diese Kirche befand sich auf dem Gebiet des heutigen Denkmalplatzes.
Um 1500 wurde der bis heute unveränderte Kirchturm von den Mönchen des Klosters Wimmelburg erbaut. Auf der Südseite des Kirchturmes ist links vom Schallloch ein graues, schlankes und rechts davon ein rotes, gedrungenes Sandsteinkreuz eingemauert. Das rote Kreuz hat die Form eines lateinischen Kreuzes. Die Form des schlanken Kreuzes ähnelt stark einem Malteser Kreuz. Hierbei könnte es sich um Sühnekreuze handeln.
Im 30-jährigen Krieg (1618-1648) wurden die Kirche und die nebenstehende Schule schwer beschädigt. Die heutige Kirche wurde 1858 an den alten Glockenturm aus dem Jahr 1500 angebaut. Ihr Altarraum steht auf den Grundmauern der alten Kirche. Im Glockenturm hängen noch heute drei funktionstüchtige Glocken, die 1921 unter Pfarrer Golling geweiht wurden. Die Kirchenuhr wurde von der weltlichen Gemeinde 1882 eingebaut und 1941 durch eine neue Turmuhr ersetzt.